כידוע, שיעור המס על רווחי הון הופחת ל-25% הן ליחיד והן לחברה. מנגד נקבע כי על חלק רווח ההון הריאלי, בגובה הפחת המתואם שנתבע החל מיום 1.1.2003, ישולם מס "בשיעור המס שחל על ההכנסה שממנה נוכה הפחת". בעניינו של יחיד "יראו את רווח ההון כשלב הגבוה ביותר בסולם ההכנסה החייבת".
אף שהרציונל של החקיקה מובן, ואף הוסבר בחוזר שהוציאה הנציבות (פחת שנתבע מקטין הכנסה בשיעורי מס גבוהים, בעוד שרווח ההון חייב במס בשיעורי מס נמוכים), ישנו חוסר בהירות במקרים שכיחים כגון: שיעורי מס אפקטיביים שונים בידי היחיד לאורך שנות ההחזקה בנכס, שנות מס עם הפסדים וכדומה.
מכל מקום נראה כי חישוב מדויק של המס שנחסך (או היה אמור להיחסך), תוך התחשבות בשנות מס עם שעורי מס נמוכים ואף בהפסדים, ראוי כי יתקבל על ידי נציבות מס הכנסה, ולא תאומץ פרשנות דווקנית לפיה יחולו שעורי המס השוליים שתיאורטית היו מוטלים על ההכנסה, בשנים עברו, ולא שיעורי המס האפקטיביים לגבי ההכנסה החייבת.
